新的命案发生，助手大宝和警长林涛着急的给法医秦明打电话，却始终没有人接听，无奈之下，只能由大宝和林涛两个人勘察现场。
是一起屋内命案，死者罗钥是屋主，邻居报的案，没有撬锁的痕迹，很可能是熟人作案。现场财务没有丢失，死者大量出血，大宝判断是大动脉被割伤导致。尸体侧躺在地面，大宝翻过尸体，却没有发现大的创口，却留了很多血。而现场有很多打斗痕迹，却没有留下任何血手印和指纹，很奇怪。
这时，有目击者来提供线索，说自己看到一个神神秘秘的人，警长林涛听着目击者的描述，想起秦明最近奇奇怪怪的行为，以及秦明最近正在调查自己父亲秦颂的案件，不禁拿出法医秦明的照片，果然就是目击者看到的神秘人。
回到解剖室，林涛告诉大宝目击者看到秦明的事情，大宝给秦明打电话，还是没有人接。林涛说自己查过死者罗钥的社会关系，和秦明以及秦明的父亲都有关系，这太巧了。大宝说自己不相信是秦明，林涛也不相信。
大宝开始解剖尸体，结合尸温，死亡时间在两三个小时左右。大宝开始清理满是血迹的尸体，林涛觉得很奇怪，这么多血，却没有看到伤口。清洗身上的血液后，终于看到一个小伤口，是利器刺入导致，其他部位再没有伤口。解剖出死者心脏，有一个很深的创口，应该是一把十厘米左右的十分锋利的细小单仁刀。大宝有些犹豫，凶手很谨慎，从作案手法看，很可能是学医的人。
林涛被专案组叫去，大宝给秦明打电话，依旧没有人接。大宝在假体上研究尸体致命伤是什么造成的，所有锋利的刀片都试过的，却还是与伤口创面不服，最后试到解剖刀，却是吻合的。
林涛向局里描述案情，死者罗钥，独居，死在家中。根据现场调查，凶手有很强的反侦察能力，并且凶器是解剖刀，再根据目击者的描述，凶手很可能是法医科长秦明。因为秦明父亲秦颂二十年前因为渎职自杀，秦明一直对此深表怀疑，而罗钥很可能就是杀死秦颂的凶手。大宝也提出，很可能也是凶手利用我们的侦查手段误导我们，像秦明这样一个有经验的法医，怎么会用解剖工具这样的证据来指向自己呢？局长表示，所有证据都指向秦明，而大宝也有必要避嫌，所以这个案子交给另一个组。
局长走后，大宝问林涛，你相信秦明吗？林涛说相信，但是法医和刑警都要根据证据判案，所以越相信秦明，我们就越要找出真相。
警察找到秦明时，秦明在家，头上有个伤口导致秦明晕厥了很久，刚刚醒来的秦明不知道发生了什么，有些抗拒，被强行带走后，警察在秦明家开始找寻证据，一把解剖刀，还有一串人体的臼齿被找到。
审讯室中，局长亲自审问秦明，秦明表示，自己还没有见到罗钥，就被打昏了。秦明承认，自己收到检举信，并且已经确定罗钥就是杀人凶手。局长又拿出一串臼齿，根据DNA比对，臼齿不是一个人的，而且都是受害者的。秦明说臼齿不是自己的，而且这一切都是有人陷害，一个精心策划的陷害，用父亲秦颂的死引导自己一步一步进入他的圈套。
大宝要求继续负责秦明的案子，但是局长不同意，让大宝还是回家休息。大宝看着审讯室中的秦明，很是无奈。