石窑村一夜间廿多名村民同时中毒，原来一切祸端，乃因村童捉蟋蟀，误掉载有毒药的竹筒入井内所致；此竹筒正是生之姐素素欲毒害御医天栽药之竹筒，素素正欲下毒之时，始知与弟掉乱竹筒，事败而回，闯下大祸。御医天替村民诊断，证实毒性乃失传已久的“血荆子”，无药可救，村民只有十天性命，生亦是受害者之一。包更收到匿名信指十年前药王秋毒害惠王爷乃被人陷害，望包代为平反。
包翻开昔日秋之卷宗，并向当年告发秋之徒弟天查问，得知当年秋提炼之不世灵药“血菘香”乃子虚乌有。生偶然得悉包在谈论井中竹筒，遂求包让他摸竹筒一下，竟发现乃素所拥有。包深入调查，发现竹筒上的刻花，与刚收到之匿名信，字迹相同；昭受命跟踪素返家，揭穿其身份，乃秋之女，谁知黄雀在后，天暗中跟踪二人，乘二人离去，在素家盗取“血荆子”毒药，更派祥往掳走生，惜打草惊蛇，失败而回。素向包承认一切，并诉说当年天勾结契丹，杀害惠王，嫁祸秋，并杀去妻，偷去“血菘香”，医治朝廷权贵，扶摇直上。
素片面之词，实难入天罪，据秋留给素之“药王篇”记载，“血菘香”能令尸体不腐，兼有紫结石在体内。包为免打草惊蛇，派昭暗中验证惠王及花(皆死於吃下过量的“血菘香”)之尸首。另一方，天派祥将盗得之“血荆子”散落多个水井之中，扩大事件，造成恐慌。果然，花尸首无恙，四子押返府中，竟遇袭，尸首掉入江中失踪；
昭独自查看惠王尸首，打草惊蛇，解犯国法，撤职查辨。中毒村民升至百余人，素往暗算天，竟反被天以“血荆子”毒针刺之，昭及时出现救回素，昭却因闪避不及，中下毒针。
村民毒发身亡期限只剩五天，六子破案心切，瞒包再起惠王尸，四子更以内功帮昭恢复功力，抑压毒性，四子因而中毒，在所不辞。果然得到证实，六子却被小惠王束手就擒，押入天牢，等候定罪；
包得验尸官带来惠王之结石及银针，但可惜乃六子私下验证，难作证供。限期只剩三天，包推测天可能将“血菘香”收藏在八贤王家的仙翁像内，果然不出所料，村民获救，叶家冤案亦平反在望。公堂上，天诸多狡辩，表示自己毫不知情，推得一干二净。包誓不低头，在两天期限内，竟侥幸捞获花尸，更逮获前来刺杀包拯的祥，更验证两位己寿终正寝，但曾被天医治过而起死回生的大臣尸首，并未腐化，再召天候审。一切真相大白，包拯要治天罪，但董太师称要斩天，必先斩素素。包拯却认为素素只是无心之失，罪不当斩。但素素为了不令包拯为难，且内疚与自己的做为，自服‘血荆子’求死。天见素素要与其同归与尽，心有不甘，竟胁持前来为他求情的妻子玉茹，导致茹难产，包拯让素素服下解药‘血菘香’帮助茹成功诞下孩儿，天亦心生悔意，替儿子取名望善。最后天依法问斩，而素素及其族人终于平冤昭雪。